研究报告/Research Report

甘薯果糖-1,6-二磷酸醛缩酶5基因(IbFBA5)的克隆与生物信息学分析  

苏在兴1 , 李强1,2 , 唐维1,2 , 刘亚菊1,2 , 后猛1,2 , 闫会1,2 , 王欣1,2 , 张允刚1,2 , 马代夫1,2
1 中国农业科学院甘薯研究所, 徐州, 221131;
2 江苏徐州甘薯研究中心, 农业部甘薯生物学与遗传育种重点实验室, 江苏徐淮地区徐州农业科学研究所, 徐州, 221131
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2015 年, 第 13 卷, 第 10 篇   
收稿日期: 2015年07月28日    接受日期: 2015年08月04日    发表日期: 2015年11月25日
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推荐引用:

Su Z.X., Li Q., Tang W., Liu Y.J., Kou M., Yan H., Wang X., Zhang Y.G., and Ma D.F., 2015, Cloning and bioinformatic analysis of Fructose-1,6-Bisphosphate Aldolase 5 gene in sweetpotato (Ipomoea batatas L.), Fenzi Zhiwu Yuzhong (Molecular Plant Breeding), 13(11): 2469-2476 (苏在兴, 李强, 唐维, 刘亚菊, 后猛, 闫会, 王欣, 张允刚, 马代夫, 2015, 甘薯果糖-1,6-二磷酸醛缩酶5基因(IbFBA5)的克隆与生物信息学分析, 分子植物育种, 13(11): 2469-2476)

摘要

本研究利用甘薯徐薯18和徐781转录组测序结果,筛选到一条与淀粉合成相关的差异表达Unigene,编号为T1-30656。以徐781为材料,克隆该片段,并对其进行重测序和生物信息学分析。结果表明,该片段为果糖-1,6-二磷酸醛缩酶基因的cDNA序列,该基因包含3个外显子和2个内含子,亚细胞定位在细胞质当中,将其命名为IbFBA5。该cDNA长为1 341 bp,含1 074 bp的开放阅读框,编码357个氨基酸。其序列与番茄、油菜、粳稻和拟南芥等相似性在77%-79%之间。

关键词
甘薯;果糖-1,6-二磷酸醛缩酶;基因克隆;生物信息学分析

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《分子植物育种》印刷版
• 第 13 卷
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